Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms