Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rprd1bQ9CSU0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd1bQ9CSU0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd1bQ9CSU0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd1bQ9CSU0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd1bQ9CSU0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd1bQ9CSU0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd1bQ9CSU0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd1bQ9CSU0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd1bQ9CSU0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd1bQ9CSU0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd1bQ9CSU0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rprd1bQ9CSU0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rprd1bQ9CSU0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rprd1bQ9CSU0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms