Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ska2Q9CR46 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ska2Q9CR46 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ska2Q9CR46 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ska2Q9CR46 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ska2Q9CR46 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ska2Q9CR46 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ska2Q9CR46 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ska2Q9CR46 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ska2Q9CR46 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ska2Q9CR46 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ska2Q9CR46 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ska2Q9CR46 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ska2Q9CR46 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ska2Q9CR46 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ska2Q9CR46 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ska2Q9CR46 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ska2Q9CR46 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ska2Q9CR46 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ska2Q9CR46 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ska2Q9CR46 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ska2Q9CR46 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ska2Q9CR46 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ska2Q9CR46 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ska2Q9CR46 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ska2Q9CR46 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ska2Q9CR46 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ska2Q9CR46 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ska2Q9CR46 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ska2Q9CR46 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ska2Q9CR46 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ska2Q9CR46 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ska2Q9CR46 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ska2Q9CR46 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ska2Q9CR46 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ska2Q9CR46 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ska2Q9CR46 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ska2Q9CR46 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ska2Q9CR46 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ska2Q9CR46 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ska2Q9CR46 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ska2Q9CR46 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ska2Q9CR46 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ska2Q9CR46 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ska2Q9CR46 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ska2Q9CR46 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ska2Q9CR46 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ska2Q9CR46 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms