Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW2

Arl8b, ADP-ribosylation factor-like protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl8bQ9CQW2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arl8bQ9CQW2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arl8bQ9CQW2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arl8bQ9CQW2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arl8bQ9CQW2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arl8bQ9CQW2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arl8bQ9CQW2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arl8bQ9CQW2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arl8bQ9CQW2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arl8bQ9CQW2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arl8bQ9CQW2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arl8bQ9CQW2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Arl8bQ9CQW2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Arl8bQ9CQW2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arl8bQ9CQW2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arl8bQ9CQW2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Arl8bQ9CQW2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Arl8bQ9CQW2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Arl8bQ9CQW2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arl8bQ9CQW2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arl8bQ9CQW2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arl8bQ9CQW2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arl8bQ9CQW2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arl8bQ9CQW2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arl8bQ9CQW2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arl8bQ9CQW2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arl8bQ9CQW2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arl8bQ9CQW2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arl8bQ9CQW2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arl8bQ9CQW2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arl8bQ9CQW2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arl8bQ9CQW2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arl8bQ9CQW2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arl8bQ9CQW2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arl8bQ9CQW2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arl8bQ9CQW2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arl8bQ9CQW2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arl8bQ9CQW2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Arl8bQ9CQW2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arl8bQ9CQW2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arl8bQ9CQW2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arl8bQ9CQW2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arl8bQ9CQW2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arl8bQ9CQW2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms