Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DenrQ9CQJ6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DenrQ9CQJ6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DenrQ9CQJ6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DenrQ9CQJ6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DenrQ9CQJ6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DenrQ9CQJ6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DenrQ9CQJ6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DenrQ9CQJ6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DenrQ9CQJ6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DenrQ9CQJ6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DenrQ9CQJ6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DenrQ9CQJ6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DenrQ9CQJ6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DenrQ9CQJ6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DenrQ9CQJ6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DenrQ9CQJ6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DenrQ9CQJ6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DenrQ9CQJ6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DenrQ9CQJ6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DenrQ9CQJ6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DenrQ9CQJ6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DenrQ9CQJ6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DenrQ9CQJ6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DenrQ9CQJ6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DenrQ9CQJ6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DenrQ9CQJ6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DenrQ9CQJ6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DenrQ9CQJ6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DenrQ9CQJ6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DenrQ9CQJ6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DenrQ9CQJ6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms