Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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