Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700029P11RikQ9CQ68 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700029P11RikQ9CQ68 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700029P11RikQ9CQ68 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700029P11RikQ9CQ68 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700029P11RikQ9CQ68 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700029P11RikQ9CQ68 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700029P11RikQ9CQ68 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700029P11RikQ9CQ68 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700029P11RikQ9CQ68 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700029P11RikQ9CQ68 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms