Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc18Q9CQ07 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc18Q9CQ07 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc18Q9CQ07 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc18Q9CQ07 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc18Q9CQ07 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms