Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt88Q9CPR6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt88Q9CPR6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt88Q9CPR6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt88Q9CPR6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt88Q9CPR6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt88Q9CPR6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt88Q9CPR6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt88Q9CPR6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt88Q9CPR6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt88Q9CPR6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt88Q9CPR6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt88Q9CPR6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt88Q9CPR6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt88Q9CPR6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt88Q9CPR6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt88Q9CPR6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt88Q9CPR6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt88Q9CPR6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt88Q9CPR6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Krt88Q9CPR6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt88Q9CPR6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt88Q9CPR6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt88Q9CPR6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt88Q9CPR6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt88Q9CPR6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt88Q9CPR6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms