Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhe41Q99PV5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bhlhe41Q99PV5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhe41Q99PV5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhe41Q99PV5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhe41Q99PV5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhe41Q99PV5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhe41Q99PV5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhe41Q99PV5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhe41Q99PV5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bhlhe41Q99PV5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bhlhe41Q99PV5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Bhlhe41Q99PV5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bhlhe41Q99PV5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhe41Q99PV5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bhlhe41Q99PV5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bhlhe41Q99PV5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bhlhe41Q99PV5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bhlhe41Q99PV5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlhe41Q99PV5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlhe41Q99PV5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlhe41Q99PV5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlhe41Q99PV5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe41Q99PV5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe41Q99PV5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe41Q99PV5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe41Q99PV5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe41Q99PV5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe41Q99PV5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe41Q99PV5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlhe41Q99PV5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlhe41Q99PV5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhe41Q99PV5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhe41Q99PV5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhe41Q99PV5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe41Q99PV5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhe41Q99PV5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhe41Q99PV5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms