Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smim3Q99PE5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim3Q99PE5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim3Q99PE5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim3Q99PE5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smim3Q99PE5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smim3Q99PE5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim3Q99PE5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim3Q99PE5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim3Q99PE5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim3Q99PE5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim3Q99PE5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim3Q99PE5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim3Q99PE5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim3Q99PE5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim3Q99PE5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim3Q99PE5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim3Q99PE5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms