Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep41Q99NF3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep41Q99NF3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep41Q99NF3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep41Q99NF3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep41Q99NF3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep41Q99NF3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep41Q99NF3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep41Q99NF3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep41Q99NF3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep41Q99NF3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep41Q99NF3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep41Q99NF3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep41Q99NF3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep41Q99NF3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cep41Q99NF3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep41Q99NF3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep41Q99NF3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cep41Q99NF3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cep41Q99NF3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep41Q99NF3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep41Q99NF3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep41Q99NF3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms