Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcam1Q99NB3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcam1Q99NB3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcam1Q99NB3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcam1Q99NB3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcam1Q99NB3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcam1Q99NB3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcam1Q99NB3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcam1Q99NB3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcam1Q99NB3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcam1Q99NB3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcam1Q99NB3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tcam1Q99NB3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcam1Q99NB3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcam1Q99NB3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcam1Q99NB3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcam1Q99NB3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcam1Q99NB3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcam1Q99NB3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcam1Q99NB3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcam1Q99NB3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcam1Q99NB3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcam1Q99NB3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcam1Q99NB3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcam1Q99NB3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcam1Q99NB3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcam1Q99NB3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcam1Q99NB3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcam1Q99NB3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcam1Q99NB3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcam1Q99NB3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcam1Q99NB3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcam1Q99NB3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcam1Q99NB3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcam1Q99NB3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcam1Q99NB3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcam1Q99NB3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcam1Q99NB3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcam1Q99NB3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcam1Q99NB3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcam1Q99NB3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcam1Q99NB3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcam1Q99NB3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcam1Q99NB3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcam1Q99NB3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcam1Q99NB3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcam1Q99NB3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms