Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rnf17Q99MV7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rnf17Q99MV7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rnf17Q99MV7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rnf17Q99MV7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rnf17Q99MV7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rnf17Q99MV7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Rnf17Q99MV7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Rnf17Q99MV7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rnf17Q99MV7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rnf17Q99MV7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rnf17Q99MV7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rnf17Q99MV7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rnf17Q99MV7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rnf17Q99MV7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rnf17Q99MV7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rnf17Q99MV7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rnf17Q99MV7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rnf17Q99MV7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rnf17Q99MV7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rnf17Q99MV7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rnf17Q99MV7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rnf17Q99MV7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rnf17Q99MV7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rnf17Q99MV7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rnf17Q99MV7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rnf17Q99MV7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Rnf17Q99MV7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Rnf17Q99MV7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rnf17Q99MV7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rnf17Q99MV7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rnf17Q99MV7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rnf17Q99MV7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rnf17Q99MV7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rnf17Q99MV7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Rnf17Q99MV7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rnf17Q99MV7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rnf17Q99MV7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rnf17Q99MV7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rnf17Q99MV7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Rnf17Q99MV7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rnf17Q99MV7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rnf17Q99MV7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rnf17Q99MV7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rnf17Q99MV7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rnf17Q99MV7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rnf17Q99MV7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rnf17Q99MV7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rnf17Q99MV7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rnf17Q99MV7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rnf17Q99MV7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rnf17Q99MV7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rnf17Q99MV7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rnf17Q99MV7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rnf17Q99MV7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rnf17Q99MV7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Rnf17Q99MV7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rnf17Q99MV7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Rnf17Q99MV7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rnf17Q99MV7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
Rnf17Q99MV7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Rnf17Q99MV7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Rnf17Q99MV7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rnf17Q99MV7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rnf17Q99MV7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Rnf17Q99MV7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Rnf17Q99MV7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Rnf17Q99MV7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Rnf17Q99MV7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Rnf17Q99MV7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rnf17Q99MV7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rnf17Q99MV7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rnf17Q99MV7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rnf17Q99MV7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rnf17Q99MV7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rnf17Q99MV7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rnf17Q99MV7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rnf17Q99MV7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rnf17Q99MV7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Rnf17Q99MV7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rnf17Q99MV7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rnf17Q99MV7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rnf17Q99MV7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rnf17Q99MV7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rnf17Q99MV7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rnf17Q99MV7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rnf17Q99MV7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rnf17Q99MV7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rnf17Q99MV7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rnf17Q99MV7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rnf17Q99MV7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rnf17Q99MV7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rnf17Q99MV7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rnf17Q99MV7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Rnf17Q99MV7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Rnf17Q99MV7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rnf17Q99MV7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rnf17Q99MV7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rnf17Q99MV7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rnf17Q99MV7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms