Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcf2Q99LE6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcf2Q99LE6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcf2Q99LE6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcf2Q99LE6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcf2Q99LE6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcf2Q99LE6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Abcf2Q99LE6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Abcf2Q99LE6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcf2Q99LE6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcf2Q99LE6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcf2Q99LE6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcf2Q99LE6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcf2Q99LE6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcf2Q99LE6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcf2Q99LE6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcf2Q99LE6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcf2Q99LE6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcf2Q99LE6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcf2Q99LE6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcf2Q99LE6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcf2Q99LE6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcf2Q99LE6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcf2Q99LE6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcf2Q99LE6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcf2Q99LE6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcf2Q99LE6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcf2Q99LE6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcf2Q99LE6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcf2Q99LE6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcf2Q99LE6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcf2Q99LE6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcf2Q99LE6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcf2Q99LE6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcf2Q99LE6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcf2Q99LE6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcf2Q99LE6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcf2Q99LE6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcf2Q99LE6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcf2Q99LE6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcf2Q99LE6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcf2Q99LE6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcf2Q99LE6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcf2Q99LE6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcf2Q99LE6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcf2Q99LE6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcf2Q99LE6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcf2Q99LE6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcf2Q99LE6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcf2Q99LE6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcf2Q99LE6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcf2Q99LE6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcf2Q99LE6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcf2Q99LE6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcf2Q99LE6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcf2Q99LE6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcf2Q99LE6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcf2Q99LE6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcf2Q99LE6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcf2Q99LE6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcf2Q99LE6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcf2Q99LE6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcf2Q99LE6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcf2Q99LE6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcf2Q99LE6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcf2Q99LE6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcf2Q99LE6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms