Protein–RNA interactions for Protein: Q99L85

Elp5, Elongator complex protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp5Q99L85 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elp5Q99L85 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elp5Q99L85 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elp5Q99L85 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp5Q99L85 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp5Q99L85 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp5Q99L85 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Elp5Q99L85 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elp5Q99L85 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Elp5Q99L85 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Elp5Q99L85 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elp5Q99L85 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elp5Q99L85 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elp5Q99L85 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elp5Q99L85 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elp5Q99L85 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elp5Q99L85 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elp5Q99L85 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elp5Q99L85 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elp5Q99L85 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elp5Q99L85 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elp5Q99L85 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elp5Q99L85 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elp5Q99L85 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elp5Q99L85 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elp5Q99L85 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elp5Q99L85 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp5Q99L85 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms