Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf34Q99KR6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf34Q99KR6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf34Q99KR6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf34Q99KR6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf34Q99KR6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf34Q99KR6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf34Q99KR6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms