Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms