Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TirapQ99JY1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TirapQ99JY1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TirapQ99JY1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TirapQ99JY1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TirapQ99JY1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TirapQ99JY1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TirapQ99JY1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TirapQ99JY1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TirapQ99JY1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TirapQ99JY1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TirapQ99JY1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TirapQ99JY1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TirapQ99JY1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TirapQ99JY1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms