Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tlcd1Q99JT6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tlcd1Q99JT6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tlcd1Q99JT6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tlcd1Q99JT6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Tlcd1Q99JT6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tlcd1Q99JT6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tlcd1Q99JT6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tlcd1Q99JT6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tlcd1Q99JT6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tlcd1Q99JT6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tlcd1Q99JT6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tlcd1Q99JT6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tlcd1Q99JT6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tlcd1Q99JT6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tlcd1Q99JT6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tlcd1Q99JT6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tlcd1Q99JT6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tlcd1Q99JT6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tlcd1Q99JT6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tlcd1Q99JT6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tlcd1Q99JT6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tlcd1Q99JT6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tlcd1Q99JT6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tlcd1Q99JT6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tlcd1Q99JT6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tlcd1Q99JT6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tlcd1Q99JT6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tlcd1Q99JT6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tlcd1Q99JT6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tlcd1Q99JT6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tlcd1Q99JT6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tlcd1Q99JT6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tlcd1Q99JT6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tlcd1Q99JT6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tlcd1Q99JT6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tlcd1Q99JT6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tlcd1Q99JT6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tlcd1Q99JT6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tlcd1Q99JT6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tlcd1Q99JT6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tlcd1Q99JT6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tlcd1Q99JT6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tlcd1Q99JT6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tlcd1Q99JT6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tlcd1Q99JT6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tlcd1Q99JT6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tlcd1Q99JT6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms