Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddb2Q99J79 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddb2Q99J79 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddb2Q99J79 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddb2Q99J79 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddb2Q99J79 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddb2Q99J79 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddb2Q99J79 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddb2Q99J79 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddb2Q99J79 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddb2Q99J79 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddb2Q99J79 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddb2Q99J79 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddb2Q99J79 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ddb2Q99J79 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddb2Q99J79 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddb2Q99J79 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddb2Q99J79 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddb2Q99J79 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddb2Q99J79 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddb2Q99J79 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddb2Q99J79 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddb2Q99J79 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddb2Q99J79 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddb2Q99J79 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddb2Q99J79 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddb2Q99J79 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms