Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nrbp1Q99J45 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nrbp1Q99J45 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Nrbp1Q99J45 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nrbp1Q99J45 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nrbp1Q99J45 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nrbp1Q99J45 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nrbp1Q99J45 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nrbp1Q99J45 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nrbp1Q99J45 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nrbp1Q99J45 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nrbp1Q99J45 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nrbp1Q99J45 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrbp1Q99J45 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrbp1Q99J45 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrbp1Q99J45 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrbp1Q99J45 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrbp1Q99J45 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrbp1Q99J45 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nrbp1Q99J45 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nrbp1Q99J45 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nrbp1Q99J45 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nrbp1Q99J45 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nrbp1Q99J45 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nrbp1Q99J45 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nrbp1Q99J45 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nrbp1Q99J45 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nrbp1Q99J45 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nrbp1Q99J45 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Nrbp1Q99J45 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nrbp1Q99J45 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nrbp1Q99J45 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nrbp1Q99J45 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nrbp1Q99J45 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Nrbp1Q99J45 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nrbp1Q99J45 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nrbp1Q99J45 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nrbp1Q99J45 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nrbp1Q99J45 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nrbp1Q99J45 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nrbp1Q99J45 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nrbp1Q99J45 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nrbp1Q99J45 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nrbp1Q99J45 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nrbp1Q99J45 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nrbp1Q99J45 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nrbp1Q99J45 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nrbp1Q99J45 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nrbp1Q99J45 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nrbp1Q99J45 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nrbp1Q99J45 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms