Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sntg1Q925E1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sntg1Q925E1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sntg1Q925E1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sntg1Q925E1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sntg1Q925E1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sntg1Q925E1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sntg1Q925E1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sntg1Q925E1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sntg1Q925E1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sntg1Q925E1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sntg1Q925E1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sntg1Q925E1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sntg1Q925E1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sntg1Q925E1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sntg1Q925E1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sntg1Q925E1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sntg1Q925E1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sntg1Q925E1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sntg1Q925E1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sntg1Q925E1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sntg1Q925E1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sntg1Q925E1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sntg1Q925E1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sntg1Q925E1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sntg1Q925E1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sntg1Q925E1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sntg1Q925E1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sntg1Q925E1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sntg1Q925E1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sntg1Q925E1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sntg1Q925E1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sntg1Q925E1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sntg1Q925E1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sntg1Q925E1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sntg1Q925E1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sntg1Q925E1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sntg1Q925E1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sntg1Q925E1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sntg1Q925E1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sntg1Q925E1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sntg1Q925E1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sntg1Q925E1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sntg1Q925E1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sntg1Q925E1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sntg1Q925E1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sntg1Q925E1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sntg1Q925E1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sntg1Q925E1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sntg1Q925E1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sntg1Q925E1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sntg1Q925E1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sntg1Q925E1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms