Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ripply3Q924S9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ripply3Q924S9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ripply3Q924S9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ripply3Q924S9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ripply3Q924S9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ripply3Q924S9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ripply3Q924S9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ripply3Q924S9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ripply3Q924S9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ripply3Q924S9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ripply3Q924S9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ripply3Q924S9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ripply3Q924S9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ripply3Q924S9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms