Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Alpk3Q924C5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Alpk3Q924C5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Alpk3Q924C5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Alpk3Q924C5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Alpk3Q924C5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Alpk3Q924C5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Alpk3Q924C5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Alpk3Q924C5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Alpk3Q924C5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Alpk3Q924C5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Alpk3Q924C5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Alpk3Q924C5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Alpk3Q924C5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Alpk3Q924C5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Alpk3Q924C5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Alpk3Q924C5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Alpk3Q924C5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Alpk3Q924C5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Alpk3Q924C5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Alpk3Q924C5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Alpk3Q924C5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Alpk3Q924C5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Alpk3Q924C5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Alpk3Q924C5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Alpk3Q924C5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Alpk3Q924C5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Alpk3Q924C5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Alpk3Q924C5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Alpk3Q924C5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Alpk3Q924C5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Alpk3Q924C5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Alpk3Q924C5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Alpk3Q924C5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Alpk3Q924C5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Alpk3Q924C5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Alpk3Q924C5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Alpk3Q924C5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Alpk3Q924C5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Alpk3Q924C5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Alpk3Q924C5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Alpk3Q924C5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Alpk3Q924C5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Alpk3Q924C5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Alpk3Q924C5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Alpk3Q924C5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Alpk3Q924C5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Alpk3Q924C5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Alpk3Q924C5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Alpk3Q924C5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Alpk3Q924C5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Alpk3Q924C5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Alpk3Q924C5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Alpk3Q924C5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Alpk3Q924C5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Alpk3Q924C5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Alpk3Q924C5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Alpk3Q924C5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Alpk3Q924C5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Alpk3Q924C5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Alpk3Q924C5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Alpk3Q924C5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Alpk3Q924C5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Alpk3Q924C5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Alpk3Q924C5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Alpk3Q924C5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Alpk3Q924C5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Alpk3Q924C5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Alpk3Q924C5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Alpk3Q924C5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Alpk3Q924C5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Alpk3Q924C5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Alpk3Q924C5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Alpk3Q924C5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Alpk3Q924C5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Alpk3Q924C5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Alpk3Q924C5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Alpk3Q924C5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Alpk3Q924C5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Alpk3Q924C5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Alpk3Q924C5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Alpk3Q924C5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Alpk3Q924C5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Alpk3Q924C5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Alpk3Q924C5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Alpk3Q924C5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Alpk3Q924C5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Alpk3Q924C5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Alpk3Q924C5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Alpk3Q924C5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Alpk3Q924C5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Alpk3Q924C5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Alpk3Q924C5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Alpk3Q924C5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.46
Alpk3Q924C5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Alpk3Q924C5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Alpk3Q924C5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Alpk3Q924C5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Alpk3Q924C5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Alpk3Q924C5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms