Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim7Q923T7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim7Q923T7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim7Q923T7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim7Q923T7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim7Q923T7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim7Q923T7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim7Q923T7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim7Q923T7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim7Q923T7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim7Q923T7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim7Q923T7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim7Q923T7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim7Q923T7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim7Q923T7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim7Q923T7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim7Q923T7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim7Q923T7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim7Q923T7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim7Q923T7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim7Q923T7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim7Q923T7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim7Q923T7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim7Q923T7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim7Q923T7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim7Q923T7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim7Q923T7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim7Q923T7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim7Q923T7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim7Q923T7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim7Q923T7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim7Q923T7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim7Q923T7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim7Q923T7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms