Protein–RNA interactions for Protein: Q922R0

Prkx, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit PRKX, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkxQ922R0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkxQ922R0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkxQ922R0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkxQ922R0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkxQ922R0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkxQ922R0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkxQ922R0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkxQ922R0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkxQ922R0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkxQ922R0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkxQ922R0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkxQ922R0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkxQ922R0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkxQ922R0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkxQ922R0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkxQ922R0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkxQ922R0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkxQ922R0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkxQ922R0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkxQ922R0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkxQ922R0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkxQ922R0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkxQ922R0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkxQ922R0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkxQ922R0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkxQ922R0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkxQ922R0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkxQ922R0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkxQ922R0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkxQ922R0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkxQ922R0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkxQ922R0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkxQ922R0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkxQ922R0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkxQ922R0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkxQ922R0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkxQ922R0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkxQ922R0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkxQ922R0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkxQ922R0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkxQ922R0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkxQ922R0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkxQ922R0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkxQ922R0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkxQ922R0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms