Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rrp1bQ91YK2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rrp1bQ91YK2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rrp1bQ91YK2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rrp1bQ91YK2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rrp1bQ91YK2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rrp1bQ91YK2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rrp1bQ91YK2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rrp1bQ91YK2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrp1bQ91YK2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrp1bQ91YK2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrp1bQ91YK2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rrp1bQ91YK2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rrp1bQ91YK2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rrp1bQ91YK2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rrp1bQ91YK2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rrp1bQ91YK2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rrp1bQ91YK2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rrp1bQ91YK2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rrp1bQ91YK2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrp1bQ91YK2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrp1bQ91YK2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrp1bQ91YK2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrp1bQ91YK2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rrp1bQ91YK2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrp1bQ91YK2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rrp1bQ91YK2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrp1bQ91YK2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrp1bQ91YK2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrp1bQ91YK2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrp1bQ91YK2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrp1bQ91YK2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrp1bQ91YK2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrp1bQ91YK2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrp1bQ91YK2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrp1bQ91YK2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrp1bQ91YK2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrp1bQ91YK2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rrp1bQ91YK2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrp1bQ91YK2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrp1bQ91YK2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrp1bQ91YK2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrp1bQ91YK2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrp1bQ91YK2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrp1bQ91YK2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrp1bQ91YK2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rrp1bQ91YK2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rrp1bQ91YK2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rrp1bQ91YK2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rrp1bQ91YK2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rrp1bQ91YK2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rrp1bQ91YK2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rrp1bQ91YK2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms