Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx15Q91WE1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx15Q91WE1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx15Q91WE1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx15Q91WE1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx15Q91WE1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx15Q91WE1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx15Q91WE1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx15Q91WE1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx15Q91WE1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx15Q91WE1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx15Q91WE1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx15Q91WE1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snx15Q91WE1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx15Q91WE1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx15Q91WE1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx15Q91WE1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx15Q91WE1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx15Q91WE1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx15Q91WE1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx15Q91WE1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx15Q91WE1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx15Q91WE1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx15Q91WE1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx15Q91WE1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx15Q91WE1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx15Q91WE1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx15Q91WE1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx15Q91WE1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snx15Q91WE1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx15Q91WE1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx15Q91WE1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx15Q91WE1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx15Q91WE1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx15Q91WE1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx15Q91WE1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx15Q91WE1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx15Q91WE1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx15Q91WE1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx15Q91WE1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snx15Q91WE1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx15Q91WE1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx15Q91WE1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms