Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 648.4 ms