Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc115Q8VE99 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc115Q8VE99 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc115Q8VE99 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc115Q8VE99 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc115Q8VE99 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc115Q8VE99 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc115Q8VE99 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc115Q8VE99 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc115Q8VE99 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc115Q8VE99 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc115Q8VE99 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc115Q8VE99 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc115Q8VE99 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc115Q8VE99 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc115Q8VE99 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc115Q8VE99 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc115Q8VE99 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc115Q8VE99 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc115Q8VE99 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc115Q8VE99 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc115Q8VE99 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc115Q8VE99 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc115Q8VE99 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc115Q8VE99 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc115Q8VE99 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc115Q8VE99 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc115Q8VE99 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc115Q8VE99 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc115Q8VE99 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc115Q8VE99 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc115Q8VE99 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc115Q8VE99 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc115Q8VE99 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc115Q8VE99 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc115Q8VE99 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc115Q8VE99 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc115Q8VE99 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc115Q8VE99 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc115Q8VE99 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc115Q8VE99 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms