Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE96

Slc35f6, Solute carrier family 35 member F6, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35f6Q8VE96 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc35f6Q8VE96 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc35f6Q8VE96 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc35f6Q8VE96 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc35f6Q8VE96 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc35f6Q8VE96 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc35f6Q8VE96 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc35f6Q8VE96 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc35f6Q8VE96 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc35f6Q8VE96 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc35f6Q8VE96 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc35f6Q8VE96 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc35f6Q8VE96 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc35f6Q8VE96 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc35f6Q8VE96 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc35f6Q8VE96 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc35f6Q8VE96 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc35f6Q8VE96 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc35f6Q8VE96 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc35f6Q8VE96 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc35f6Q8VE96 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc35f6Q8VE96 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc35f6Q8VE96 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc35f6Q8VE96 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc35f6Q8VE96 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc35f6Q8VE96 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc35f6Q8VE96 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc35f6Q8VE96 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc35f6Q8VE96 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc35f6Q8VE96 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc35f6Q8VE96 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc35f6Q8VE96 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc35f6Q8VE96 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc35f6Q8VE96 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc35f6Q8VE96 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc35f6Q8VE96 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc35f6Q8VE96 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc35f6Q8VE96 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc35f6Q8VE96 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc35f6Q8VE96 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc35f6Q8VE96 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms