Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc39cQ8VE09 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc39cQ8VE09 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc39cQ8VE09 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc39cQ8VE09 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc39cQ8VE09 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc39cQ8VE09 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc39cQ8VE09 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc39cQ8VE09 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc39cQ8VE09 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc39cQ8VE09 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc39cQ8VE09 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc39cQ8VE09 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc39cQ8VE09 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc39cQ8VE09 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc39cQ8VE09 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc39cQ8VE09 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc39cQ8VE09 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc39cQ8VE09 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc39cQ8VE09 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc39cQ8VE09 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc39cQ8VE09 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc39cQ8VE09 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc39cQ8VE09 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc39cQ8VE09 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc39cQ8VE09 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc39cQ8VE09 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc39cQ8VE09 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc39cQ8VE09 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc39cQ8VE09 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc39cQ8VE09 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc39cQ8VE09 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc39cQ8VE09 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc39cQ8VE09 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc39cQ8VE09 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc39cQ8VE09 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc39cQ8VE09 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc39cQ8VE09 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc39cQ8VE09 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc39cQ8VE09 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc39cQ8VE09 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc39cQ8VE09 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc39cQ8VE09 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc39cQ8VE09 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc39cQ8VE09 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc39cQ8VE09 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc39cQ8VE09 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc39cQ8VE09 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms