Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubg2Q8VCK3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubg2Q8VCK3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubg2Q8VCK3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubg2Q8VCK3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubg2Q8VCK3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubg2Q8VCK3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubg2Q8VCK3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubg2Q8VCK3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubg2Q8VCK3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubg2Q8VCK3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubg2Q8VCK3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubg2Q8VCK3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubg2Q8VCK3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubg2Q8VCK3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubg2Q8VCK3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubg2Q8VCK3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubg2Q8VCK3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubg2Q8VCK3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubg2Q8VCK3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubg2Q8VCK3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubg2Q8VCK3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubg2Q8VCK3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubg2Q8VCK3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubg2Q8VCK3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubg2Q8VCK3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubg2Q8VCK3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubg2Q8VCK3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubg2Q8VCK3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubg2Q8VCK3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubg2Q8VCK3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubg2Q8VCK3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubg2Q8VCK3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubg2Q8VCK3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubg2Q8VCK3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tubg2Q8VCK3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubg2Q8VCK3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubg2Q8VCK3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubg2Q8VCK3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubg2Q8VCK3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubg2Q8VCK3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubg2Q8VCK3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubg2Q8VCK3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubg2Q8VCK3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms