Protein–RNA interactions for Protein: Q8R480

Nup85, Nuclear pore complex protein Nup85, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup85Q8R480 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup85Q8R480 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup85Q8R480 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup85Q8R480 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup85Q8R480 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup85Q8R480 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup85Q8R480 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup85Q8R480 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup85Q8R480 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup85Q8R480 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup85Q8R480 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup85Q8R480 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup85Q8R480 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup85Q8R480 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup85Q8R480 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup85Q8R480 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup85Q8R480 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup85Q8R480 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nup85Q8R480 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup85Q8R480 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup85Q8R480 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup85Q8R480 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup85Q8R480 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup85Q8R480 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup85Q8R480 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup85Q8R480 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup85Q8R480 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup85Q8R480 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup85Q8R480 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup85Q8R480 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup85Q8R480 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup85Q8R480 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup85Q8R480 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup85Q8R480 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup85Q8R480 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup85Q8R480 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup85Q8R480 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup85Q8R480 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup85Q8R480 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup85Q8R480 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup85Q8R480 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup85Q8R480 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup85Q8R480 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup85Q8R480 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup85Q8R480 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup85Q8R480 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup85Q8R480 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup85Q8R480 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup85Q8R480 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup85Q8R480 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup85Q8R480 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup85Q8R480 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup85Q8R480 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup85Q8R480 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup85Q8R480 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup85Q8R480 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup85Q8R480 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup85Q8R480 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup85Q8R480 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup85Q8R480 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms