Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N2

Utp4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp4Q8R2N2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp4Q8R2N2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp4Q8R2N2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp4Q8R2N2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp4Q8R2N2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp4Q8R2N2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp4Q8R2N2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp4Q8R2N2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp4Q8R2N2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp4Q8R2N2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp4Q8R2N2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp4Q8R2N2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp4Q8R2N2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp4Q8R2N2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp4Q8R2N2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Utp4Q8R2N2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp4Q8R2N2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp4Q8R2N2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp4Q8R2N2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp4Q8R2N2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp4Q8R2N2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp4Q8R2N2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp4Q8R2N2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp4Q8R2N2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp4Q8R2N2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp4Q8R2N2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Utp4Q8R2N2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Utp4Q8R2N2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Utp4Q8R2N2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp4Q8R2N2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp4Q8R2N2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp4Q8R2N2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp4Q8R2N2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp4Q8R2N2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp4Q8R2N2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp4Q8R2N2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp4Q8R2N2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp4Q8R2N2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp4Q8R2N2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp4Q8R2N2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp4Q8R2N2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp4Q8R2N2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms