Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1M2

H2afj, Histone H2A.J, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afjQ8R1M2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2afjQ8R1M2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2afjQ8R1M2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afjQ8R1M2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
H2afjQ8R1M2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afjQ8R1M2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afjQ8R1M2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afjQ8R1M2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afjQ8R1M2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afjQ8R1M2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afjQ8R1M2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afjQ8R1M2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afjQ8R1M2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afjQ8R1M2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afjQ8R1M2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afjQ8R1M2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afjQ8R1M2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afjQ8R1M2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afjQ8R1M2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afjQ8R1M2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2afjQ8R1M2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2afjQ8R1M2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2afjQ8R1M2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afjQ8R1M2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afjQ8R1M2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afjQ8R1M2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afjQ8R1M2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afjQ8R1M2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afjQ8R1M2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afjQ8R1M2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afjQ8R1M2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afjQ8R1M2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afjQ8R1M2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afjQ8R1M2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afjQ8R1M2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afjQ8R1M2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afjQ8R1M2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afjQ8R1M2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afjQ8R1M2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afjQ8R1M2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H2afjQ8R1M2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
H2afjQ8R1M2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afjQ8R1M2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H2afjQ8R1M2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms