Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defb12Q8K4N3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defb12Q8K4N3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defb12Q8K4N3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defb12Q8K4N3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Defb12Q8K4N3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb12Q8K4N3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb12Q8K4N3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb12Q8K4N3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb12Q8K4N3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb12Q8K4N3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb12Q8K4N3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defb12Q8K4N3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb12Q8K4N3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defb12Q8K4N3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Defb12Q8K4N3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defb12Q8K4N3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defb12Q8K4N3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Defb12Q8K4N3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defb12Q8K4N3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Defb12Q8K4N3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defb12Q8K4N3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defb12Q8K4N3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defb12Q8K4N3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defb12Q8K4N3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defb12Q8K4N3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms