Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc3Q8K3W3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Casc3Q8K3W3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casc3Q8K3W3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casc3Q8K3W3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc3Q8K3W3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc3Q8K3W3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc3Q8K3W3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casc3Q8K3W3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casc3Q8K3W3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc3Q8K3W3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc3Q8K3W3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc3Q8K3W3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc3Q8K3W3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc3Q8K3W3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc3Q8K3W3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc3Q8K3W3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc3Q8K3W3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc3Q8K3W3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casc3Q8K3W3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casc3Q8K3W3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casc3Q8K3W3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc3Q8K3W3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc3Q8K3W3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc3Q8K3W3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc3Q8K3W3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc3Q8K3W3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc3Q8K3W3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc3Q8K3W3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc3Q8K3W3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casc3Q8K3W3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casc3Q8K3W3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casc3Q8K3W3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casc3Q8K3W3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Casc3Q8K3W3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casc3Q8K3W3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casc3Q8K3W3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casc3Q8K3W3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casc3Q8K3W3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casc3Q8K3W3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casc3Q8K3W3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casc3Q8K3W3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc3Q8K3W3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc3Q8K3W3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casc3Q8K3W3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casc3Q8K3W3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casc3Q8K3W3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casc3Q8K3W3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc3Q8K3W3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc3Q8K3W3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc3Q8K3W3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc3Q8K3W3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casc3Q8K3W3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc3Q8K3W3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc3Q8K3W3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc3Q8K3W3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casc3Q8K3W3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc3Q8K3W3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc3Q8K3W3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc3Q8K3W3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms