Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A0

Hscb, Iron-sulfur cluster co-chaperone protein HscB, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HscbQ8K3A0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HscbQ8K3A0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HscbQ8K3A0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HscbQ8K3A0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HscbQ8K3A0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HscbQ8K3A0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HscbQ8K3A0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HscbQ8K3A0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HscbQ8K3A0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HscbQ8K3A0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HscbQ8K3A0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HscbQ8K3A0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HscbQ8K3A0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HscbQ8K3A0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HscbQ8K3A0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HscbQ8K3A0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms