Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsl1Q8K305 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsl1Q8K305 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nsl1Q8K305 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsl1Q8K305 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsl1Q8K305 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsl1Q8K305 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nsl1Q8K305 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nsl1Q8K305 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nsl1Q8K305 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nsl1Q8K305 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nsl1Q8K305 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nsl1Q8K305 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nsl1Q8K305 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nsl1Q8K305 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nsl1Q8K305 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsl1Q8K305 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsl1Q8K305 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsl1Q8K305 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nsl1Q8K305 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nsl1Q8K305 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nsl1Q8K305 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms