Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc5a11Q8K0E3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc5a11Q8K0E3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc5a11Q8K0E3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc5a11Q8K0E3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms