Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nupl2Q8CIC2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nupl2Q8CIC2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nupl2Q8CIC2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nupl2Q8CIC2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nupl2Q8CIC2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nupl2Q8CIC2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nupl2Q8CIC2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nupl2Q8CIC2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nupl2Q8CIC2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nupl2Q8CIC2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nupl2Q8CIC2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nupl2Q8CIC2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nupl2Q8CIC2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nupl2Q8CIC2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nupl2Q8CIC2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nupl2Q8CIC2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nupl2Q8CIC2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nupl2Q8CIC2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nupl2Q8CIC2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nupl2Q8CIC2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nupl2Q8CIC2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nupl2Q8CIC2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nupl2Q8CIC2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nupl2Q8CIC2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms