Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
9030612E09RikQ8CE20 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
9030612E09RikQ8CE20 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
9030612E09RikQ8CE20 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
9030612E09RikQ8CE20 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
9030612E09RikQ8CE20 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
9030612E09RikQ8CE20 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
9030612E09RikQ8CE20 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
9030612E09RikQ8CE20 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
9030612E09RikQ8CE20 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
9030612E09RikQ8CE20 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
9030612E09RikQ8CE20 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
9030612E09RikQ8CE20 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
9030612E09RikQ8CE20 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
9030612E09RikQ8CE20 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
9030612E09RikQ8CE20 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
9030612E09RikQ8CE20 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
9030612E09RikQ8CE20 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
9030612E09RikQ8CE20 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
9030612E09RikQ8CE20 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
9030612E09RikQ8CE20 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
9030612E09RikQ8CE20 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
9030612E09RikQ8CE20 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
9030612E09RikQ8CE20 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
9030612E09RikQ8CE20 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
9030612E09RikQ8CE20 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
9030612E09RikQ8CE20 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
9030612E09RikQ8CE20 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
9030612E09RikQ8CE20 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms