Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
6030452D12RikQ8CD33 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6030452D12RikQ8CD33 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
6030452D12RikQ8CD33 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
6030452D12RikQ8CD33 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
6030452D12RikQ8CD33 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
6030452D12RikQ8CD33 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
6030452D12RikQ8CD33 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
6030452D12RikQ8CD33 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
6030452D12RikQ8CD33 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
6030452D12RikQ8CD33 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
6030452D12RikQ8CD33 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
6030452D12RikQ8CD33 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
6030452D12RikQ8CD33 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
6030452D12RikQ8CD33 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
6030452D12RikQ8CD33 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
6030452D12RikQ8CD33 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
6030452D12RikQ8CD33 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms