Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RybpQ8CCI5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RybpQ8CCI5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RybpQ8CCI5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RybpQ8CCI5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RybpQ8CCI5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RybpQ8CCI5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RybpQ8CCI5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RybpQ8CCI5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RybpQ8CCI5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RybpQ8CCI5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RybpQ8CCI5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RybpQ8CCI5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms