Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Podxl2Q8CAE9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Podxl2Q8CAE9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Podxl2Q8CAE9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Podxl2Q8CAE9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Podxl2Q8CAE9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Podxl2Q8CAE9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Podxl2Q8CAE9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Podxl2Q8CAE9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Podxl2Q8CAE9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Podxl2Q8CAE9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Podxl2Q8CAE9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Podxl2Q8CAE9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Podxl2Q8CAE9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Podxl2Q8CAE9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Podxl2Q8CAE9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Podxl2Q8CAE9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Podxl2Q8CAE9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Podxl2Q8CAE9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Podxl2Q8CAE9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Podxl2Q8CAE9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Podxl2Q8CAE9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Podxl2Q8CAE9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Podxl2Q8CAE9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Podxl2Q8CAE9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Podxl2Q8CAE9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Podxl2Q8CAE9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Podxl2Q8CAE9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Podxl2Q8CAE9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Podxl2Q8CAE9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Podxl2Q8CAE9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Podxl2Q8CAE9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Podxl2Q8CAE9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Podxl2Q8CAE9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Podxl2Q8CAE9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Podxl2Q8CAE9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Podxl2Q8CAE9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Podxl2Q8CAE9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Podxl2Q8CAE9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Podxl2Q8CAE9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Podxl2Q8CAE9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Podxl2Q8CAE9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Podxl2Q8CAE9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Podxl2Q8CAE9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Podxl2Q8CAE9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Podxl2Q8CAE9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Podxl2Q8CAE9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Podxl2Q8CAE9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Podxl2Q8CAE9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Podxl2Q8CAE9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Podxl2Q8CAE9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Podxl2Q8CAE9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Podxl2Q8CAE9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Podxl2Q8CAE9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Podxl2Q8CAE9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Podxl2Q8CAE9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Podxl2Q8CAE9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Podxl2Q8CAE9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Podxl2Q8CAE9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Podxl2Q8CAE9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Podxl2Q8CAE9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Podxl2Q8CAE9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Podxl2Q8CAE9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Podxl2Q8CAE9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Podxl2Q8CAE9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Podxl2Q8CAE9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Podxl2Q8CAE9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Podxl2Q8CAE9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Podxl2Q8CAE9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms