Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930507D05RikQ8C9C9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930507D05RikQ8C9C9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930507D05RikQ8C9C9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930507D05RikQ8C9C9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930507D05RikQ8C9C9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930507D05RikQ8C9C9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930507D05RikQ8C9C9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930507D05RikQ8C9C9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930507D05RikQ8C9C9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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4930507D05RikQ8C9C9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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4930507D05RikQ8C9C9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4930507D05RikQ8C9C9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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4930507D05RikQ8C9C9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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4930507D05RikQ8C9C9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930507D05RikQ8C9C9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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4930507D05RikQ8C9C9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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4930507D05RikQ8C9C9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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4930507D05RikQ8C9C9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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4930507D05RikQ8C9C9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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4930507D05RikQ8C9C9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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4930507D05RikQ8C9C9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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4930507D05RikQ8C9C9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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4930507D05RikQ8C9C9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930507D05RikQ8C9C9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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4930507D05RikQ8C9C9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930507D05RikQ8C9C9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930507D05RikQ8C9C9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4930507D05RikQ8C9C9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4930507D05RikQ8C9C9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4930507D05RikQ8C9C9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4930507D05RikQ8C9C9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4930507D05RikQ8C9C9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4930507D05RikQ8C9C9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4930507D05RikQ8C9C9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4930507D05RikQ8C9C9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4930507D05RikQ8C9C9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
4930507D05RikQ8C9C9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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