Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc159Q8C963 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc159Q8C963 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc159Q8C963 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc159Q8C963 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc159Q8C963 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc159Q8C963 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms