Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ska3Q8C263 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ska3Q8C263 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ska3Q8C263 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ska3Q8C263 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ska3Q8C263 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ska3Q8C263 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ska3Q8C263 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ska3Q8C263 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ska3Q8C263 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ska3Q8C263 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ska3Q8C263 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ska3Q8C263 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ska3Q8C263 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ska3Q8C263 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ska3Q8C263 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ska3Q8C263 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ska3Q8C263 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ska3Q8C263 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ska3Q8C263 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ska3Q8C263 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ska3Q8C263 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ska3Q8C263 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ska3Q8C263 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ska3Q8C263 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ska3Q8C263 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ska3Q8C263 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ska3Q8C263 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ska3Q8C263 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ska3Q8C263 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ska3Q8C263 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ska3Q8C263 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ska3Q8C263 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ska3Q8C263 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ska3Q8C263 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ska3Q8C263 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ska3Q8C263 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ska3Q8C263 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ska3Q8C263 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ska3Q8C263 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ska3Q8C263 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ska3Q8C263 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ska3Q8C263 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ska3Q8C263 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms